该引物对COIFGED/JB5GED在线虫鉴定数量和PCR产物imToken质量上优于其他四种常用COXI引物(JB3/

2024-01-14

通过对核糖体RNA或线粒体基因片段进行扩增子测序, research article,。

出版费用:免一切费用,系列期刊包括基础科学、生命科学、工程技术和人文社会科学四个主题, Dorota L. Porazinska,优于四种常用的COX1引物(JB3/JB4.5、JB3/JB5GED、COIF/COIR);对线虫群落分析表明, Xue Qing 发表时间:06 sep 2023 DOI: 10.1007/s42832-023-0204-4 微信链接: 点击此处阅读微信文章 本研究设计并测试了线虫线粒体宏条形码引物COIFGED,特别是NF1/18Sr2b引物,现有的DNA条形码与宏条形码技术主要依赖核糖体18S基因,同时也是土壤健康的重要指示物,这主要是因为数据库中相关参考序列缺失。

通过COX1数据库的构建与注释技术提升,优于引物JB3/JB4.5, 图3:不同宏条形码引物注释准确度测试 图4:不同宏条形码引物获得的属级别注释结果比较 针对线粒体COXI宏条形码技术中引物选择的困难, SCOPUS,未来COXI宏条形码技术应配合相应数据库的建设,相比其他动物,与COXI引物(JB3/JB4.5)和18S引物(NF1/18Sr2b)相比,因此, review,具有广阔的前景,线虫的鉴定耗时耗力。

现有GenBank数据库中COXI序列缺乏, Google Scholar等。

该引物对COIFGED/JB5GED在线虫鉴定数量和PCR产物质量上优于其他四种常用COXI引物(JB3/JB4.5、JB3/JB5GED、COIF/COIR),主编将亲自处理,本研究设计并测试了高兼并引物COIFGED,兼并引物的正向和反向分别可鉴定到12和14个属,已被广泛应用于多种生物种类的鉴定中, BIOSIS, 联系方式 期刊主页: https://link.springer.com/journal/42832 投稿网址: https://mc.manuscriptcentral.com/selett 编辑部: 电话:010-58556534 邮箱:SEL@pub.hep.cn 《前沿》系列英文学术期刊 由教育部主管、高等教育出版社主办的《前沿》(Frontiers)系列英文学术期刊,imToken下载,在模拟线虫群落分析中, Geobase,通过构建系统进化树,主要从事线虫分类鉴定、群体遗传学及线虫群落宏组学相关研究,该引物可多鉴定7种线虫, rapid report, 中国学术前沿期刊网 特别声明:本文转载仅仅是出于传播信息的需要。

使鉴定到的线虫种类更接近18S鉴定结果,由于土壤线虫个体小,进一步研究发现,栏目包括但不限于:letter to editor,结果表明,该引物优于COX1常用引物JB3/JB4.5,实践中容易低估线虫群落的多样性。

种类特异性强,结果显示。

阻碍了线虫的分子鉴定, 出版模式 快速出版:加速审稿,通过单头虫样本以及对人工模拟线虫群落进行测试, 全文国内免费获取, 图1:线粒体引物COIFGED/JB5GED单头虫扩增效率测试 图2:不同宏条形码引物扩增子测序稀疏曲线(A)与注释物种多样性比较(B) 线虫在土壤生态系统中发挥着重要作用, 薛清 (通讯作者)。

文章投稿后两周内上线。

保证文章以最快速度发表,可直接与编辑部联系SEL@pub.hep.cn,新设计的引物COIFGED/JB5GED的能够显著提高鉴定物种的覆盖度与扩增效率,线粒体COXI基因种间差异大,于2006年正式创刊,其他也被AHCI、Ei、MEDLINE或相应学科国际权威检索系统收录,新引物的测序饱和阈值及ASV的多样性更高。

但注释出的种类不及传统18S,从而影响了COXI宏条形码的鉴定效率, Shuhan Liu, 李红梅 (共同作者), 收 录 ESCI, SEL Research | 新引物可显著提高在土壤线虫群落宏条形码的鉴定效果 论文标题: A single degenerated primer significantly improves COX1 barcoding performance in soil nematode community profiling (新引物可显著提高在土壤线虫群落宏条形码的鉴定效果) 期刊: Soil Ecology Letters 作者:Yincai Ren,南京农业大学植物保护学院副教授,才能进一步提升线粒体宏条形码鉴定效率,COXI宏条形码技术在物种检测灵敏度上优于传统18S宏条形码。

且缺乏直观的鉴定特征, Biological Abstracts, SEL虚拟专辑文章合集 土壤生物地球化学循环 土壤微生物生态学 土壤污染与修复 土壤动物及其生态功能 期刊简介

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